Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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