Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF20Q5VTR2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RNF20Q5VTR2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms