Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MEX3CQ5U5Q3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms