Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF628Q5EBL2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF628Q5EBL2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms