Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRRC23Q53EV4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms