Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC38Q502W7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms