Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SP6Q3SY56 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms