Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms