Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPC1Q16533 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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