Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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