Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GRIK5Q16478 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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