Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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