Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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