Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SEC23BQ15437 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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SEC23BQ15437 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SEC23BQ15437 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SEC23BQ15437 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SEC23BQ15437 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SEC23BQ15437 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC23BQ15437 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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