Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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