Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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NCF4Q15080 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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NCF4Q15080 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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NCF4Q15080 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCF4Q15080 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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