Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRCAPQ14761 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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