Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
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BECN1Q14457 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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BECN1Q14457 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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BECN1Q14457 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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BECN1Q14457 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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BECN1Q14457 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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BECN1Q14457 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BECN1Q14457 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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