Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSHL1Q14406 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms