Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCGQ13326 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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