Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTGDRQ13258 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms