Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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