Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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CBX3Q13185 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CBX3Q13185 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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CBX3Q13185 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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CBX3Q13185 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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CBX3Q13185 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CBX3Q13185 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX3Q13185 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX3Q13185 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX3Q13185 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CBX3Q13185 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX3Q13185 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX3Q13185 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX3Q13185 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX3Q13185 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CBX3Q13185 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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