Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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