Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA3Q08378 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA3Q08378 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms