Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOS1Q07889 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms