Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms