Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN12Q05209 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms