Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms