Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms