Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC6A3Q01959 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms