Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms