Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms