Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2BQ00403 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms