Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMF1P82094 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMF1P82094 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms