Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SIM1P81133 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIM1P81133 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIM1P81133 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIM1P81133 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SIM1P81133 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIM1P81133 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms