Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARF6P62330 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ARF6P62330 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARF6P62330 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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