Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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