Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP5P51878 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP5P51878 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP5P51878 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP5P51878 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms