Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms