Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF9P41273 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFSF9P41273 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF9P41273 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF9P41273 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF9P41273 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF9P41273 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF9P41273 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF9P41273 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF9P41273 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF9P41273 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF9P41273 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF9P41273 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFSF9P41273 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms