Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGM1P36871 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PGM1P36871 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGM1P36871 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGM1P36871 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PGM1P36871 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGM1P36871 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGM1P36871 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGM1P36871 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGM1P36871 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGM1P36871 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGM1P36871 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGM1P36871 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGM1P36871 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGM1P36871 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGM1P36871 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGM1P36871 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PGM1P36871 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGM1P36871 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms