Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD12P35452 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms