Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNB1P35222 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms