Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CD40LGP29965 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CD40LGP29965 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CD40LGP29965 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CD40LGP29965 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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