Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB9P28065 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB9P28065 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms