Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GADD45AP24522 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GADD45AP24522 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GADD45AP24522 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GADD45AP24522 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GADD45AP24522 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GADD45AP24522 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GADD45AP24522 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GADD45AP24522 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GADD45AP24522 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GADD45AP24522 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GADD45AP24522 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms