Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPH2P23942 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms