Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHCEP18577 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHCEP18577 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHCEP18577 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms