Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP4P12644 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BMP4P12644 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BMP4P12644 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BMP4P12644 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BMP4P12644 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BMP4P12644 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms